대한불교조계종(총무원장 자승 스님)은 6월 12일 "지혜와 단합된 의지로 메르스를 극복해 나가자"는 내용의 대변인(기획실장 일감 스님) 메시지를 발표했다.

조계종은 메시지를 통해 "국민들이 서로를 믿고 희망을 이야기하면, 우리의 삶에서 아름다운 연꽃을 피워낼 수 있을 것"이라며 메르스로 인한 아픔과 불안을 떨쳐내고, 국민 모두가 건강하고 행복하기를 기원했다.

또 보조국사 지눌 스님의 '우리를 괴롭히는 고난과 역경을 피하지 말고 부딪혀 이겨내라'는 말을 인용하고 "재난은 언제든지 올 수 있으나 함께 하는 지혜와 의지로 거뜬히 이겨낼 수 있다"면서 "전국 불자들은 사회를 껴안겠다는 마음으로 수행에 진력하고 여기서 오는 맑은 기운으로 현재에 처한 사회적 아픔을 함께 치유해 나갈 수 있도록 노력을 다하자"고 밝혔다. 

한편 조계종은 전국 교구본사와 주요사찰에 전국 사찰과 불자들이 메르스로 고통 받는 국민들과 의료진, 담당 공무원들을 위로하고 지역사회와 함께 힘을 모아 슬기롭게 이겨낼 수 있도록 노력을 다해줄 것을 당부하고 △의료진 및 의료기관, 담당 공무원 격려 △불편을 겪는 국민들에 대한 위로 △격려와 위로의 내용을 담은 현수막 설치 등에 동참해 줄 것을 요청하는 공문을 발송했다.